6月16日，北京市中医管理局印发《北京市新型冠状病毒肺炎中医药防治方案（试行第五版）》的通知。连花清瘟颗粒（胶囊）被推荐用于医学观察病例/医学隔离病例和成人确诊病例中疫邪外犯证、疫毒袭肺证、疫毒闭肺证的治疗。
通知提到，当前，全球新型冠状病毒肺炎（以下简称新冠肺炎）疫情形势仍很严重，近期北京市又出现本地病例，为进一步加强新冠肺炎中医药救治工作的精准性和规范性，推进中西医协同提高治愈率、降低病死率，在总结先期中医药对新冠肺炎救治经验的基础上，对《北京市新型冠状病毒肺炎中医药防治方案（试行第四版）》进行修订，形成了《北京市新型冠状病毒肺炎中医药防治方案（试行第五版）》。
新冠肺炎属于中医“疫病”范畴，湿毒疫疠之气，自口鼻而入，郁肺困脾，临床可见发热、咳嗽、乏力、大便溏泻或不爽，甚者气促。部分患者湿从热化，壅闭于肺而出现高热、喘憋等重症状态，终至正虚邪陷、内闭外脱之危候。
连花清瘟是运用中医络病理论探讨外感温病及瘟疫传变的规律及治疗，提出“积极干预”治疗对策，制定“清瘟解毒，宣肺泄热”治法。组方吸取历代医家治疗疫证的用药精华，以汉代张仲景《伤寒论》中专治疫病的麻杏石甘汤与清代吴鞠通《温病条辨》中专治疫病的银翘散化裁，汲取明代吴又可《温疫论》治疫证用大黄经验。麻杏石甘汤，宣肺泄热、止咳平喘；银翘散，清瘟解毒、辛凉宣肺，两个药方针对疫病发热咳嗽、喘促气短用药。现代药理研究发现，两个药方都具有良好的退热、止咳、抗炎、抗病毒作用。
连花清瘟处方中除应用麻杏石甘汤与银翘散之外，还具有三大用药特点。首先采用大黄通腑泄肺，肺与大肠相表里，让“疫毒”从大便排出，使邪有出路；使用大黄另一价值是先证用药，截断病势。明代吴又可曾指出：瘟疫治疗宜在人体正气未衰之时，及早攻逐邪气，提前应用通便的大黄，可以截断病情向危重传变。现代药效研究证实大黄具有抑制肺部炎症，改善肺功能作用。第二，运用藿香芳香化湿、避秽化浊，改善食欲不振、湿困脾胃的状况。第三，连花清瘟中还有关键的一味药是红景天，它生长在高寒、高海拔地区，以提高人体抗疲劳、耐缺氧能力。同时红景天增强免疫的作用可以改善患者淋巴细胞及亚群偏低造成的机体抗病能力下降，提高机体的抗病康复能力。
据了解，连花清瘟从年进入市场至今，已经获得国家层面20余次方案推荐，从甲型流感、乙型流感、禽流感到新型冠状病毒性肺炎，在这十几年我国发生的所有病毒传染性重大公共卫生事件中，连花清瘟都获得了治疗方案推荐，曾被列入《流行性感冒诊断与治疗指南》《人感染甲型H1N1流感诊疗方案》《乙型流感中医药防治方案》《人感染H7N9禽流感诊疗方案》《流行性感冒诊疗方案(年版)》《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第四至第七版）》等方案。连花清瘟胶囊的科研成果获得了年度国家科技进步二等奖。
